簡單地說，設置為雙拼輸入模式，借助“自定義短語”功能進一步完善輔助碼和簡碼輸入，并使用賬號登錄和同步功能實現在所有電腦中暢通使用。
一、搜狗拼音輸入法解決方案
在設置了“自然碼”的“雙拼”模式后，在【高級】【自定義短語設置】【直接編輯配置文件】中，將附件中的【搜狗自定義短語.txt】內容替換。
使用搜狗賬號（也可用QQ和微博賬號）登陸后，在【賬戶】中，使用“上傳或下載配置”“同步詞庫”，也可在不同電腦上使用。
二、共性說明
搜狗拼音和QQ拼音能完美支持64位平臺，具有詞庫更新、賬號同步功能，這些都是自然碼不具備的實用功能。而且和自然碼一樣都具有整句輸入功能。
自然碼不是系統自帶的（UCDOS除外），那些年我們一起追過自然碼時，隨身攜帶的除了鑰匙和錢包，就是一張1.44MB的自然碼軟盤。現在我們繼續使用自然碼，只需要一個賬號就行。感謝強大的互聯網搜狗和QQ輸入法替代自然碼輸入法完美解決方案！
上面附件中自定義短語文件與網上流傳的不一樣，網上流傳的可能是軟件提取的，存在亂碼和瑕疵。這里提供的文件對所有編碼和候選位置進行了人工校正（如wj是“萬”不是“卍”），并增加了符號和偏旁的編碼，應該是當前最全面、最準確的版本了。
替換了附件中的“自定義短語”后，能夠完美實現以下功能：
1、可以使用1～2位輔助碼輸入單字，如lim為“李”，wfdw為“刎”。
2、可以使用自然碼的一、二、三級簡碼，如w、wa、waa分別為“我”“挖”“瓦”。
3、可以直接輸入符號，如oi或os為數字符號，ofuu為“℃”。
4、可以直接輸入偏旁部首，pp為偏旁，如ppr為“亻”。
5、可以使用o鍵對不知道讀音的難字切形輸入，如omuda為“榙”。
這個不是詞庫是字庫，搜狗本身自帶了強大的詞庫，沒有必要再做詞庫了，而且自定義短語文件太大也會影響速度。如果愿意折騰，可自行加入其他個人詞語、符號乃至立體詞。
搜狗拼音的自定義短語雖然都是*.ini文件，但數據格式不一樣，可以借助*.csv逗號分隔符文件格式和Excel2003軟件進行互換，也可以借助專門的轉換軟件轉換。
立體詞是一個很酷的功能，當年虐待五筆粉絲或動員別人學自然碼時，就是輸出自造立體詞給他看搜狗和QQ輸入法替代自然碼輸入法完美解決方案。
還有其他的一些設置（如用分號和引號選二三字，用方括號翻頁，標點符號的輸入、特殊符號的輸入等），請自行琢磨，這里不一一列舉了。而且建議關閉詞語聯想、固定首位等功能，可以獲得更好的輸入體驗。
效果展示
截圖太麻煩，這里只展示搜狗的效果圖。QQ拼音除細胞詞庫和整句輸入外，其實做得更好。我的自定義短語經過了進一步的整理，和上傳的附件中編碼不完全一致。
1、一級簡碼單字（一）
2、二級簡碼單字（眼）
3、三級簡碼單字（即一位輔助碼）（鹽）
4、四級簡碼單字（即二位輔助碼）（閆）
5、不知道讀音的難字切形輸入（秡）
6、符號直接輸入（Ⅰ、⑤）
7、偏旁直接輸入（丶）
8、雙字詞語（自由）
9、三字詞語（計算機、習近平）
10、四字詞語（無以倫比、美不勝收）
11、多字詞語（據不完全統計、中華人民共和國）
12、很長的自造詞，可以是多行的立體詞（收貨地址：湖北省宜昌市長江大道110-119號，徐近平收，郵編：443300，聯系電話：13987654321）
注：以上8～12項出自我的個人詞庫，搜狗本身能在一定程度上實現2～4字的超級簡拼。
13、整句輸入
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